A epúlide congênita é um tumor incomum dos tecidos moles, encontrada principalmente no rebordo alveolar, cujo tratamento usual é a excisão cirúrgica, entretanto existem relatos de regressão completa da lesão mesmo sem tratamento

Os grânulos de Fordyce, apesar de mais comuns em adultos, também podem surgir com a puberdade. São glândulas sebáceas que ocorrem na mucosa oral, e devem ser consideradas variação anatômica normal, sem necessidade de tratamento

A disceratose congênita, usualmente torna-se evidente durante os 10 primeiros anos de vida. Na mucosa oral, apresenta-se como petéquias em palato mole que levam à ardência

O nevo branco esponjoso é herdado como um traço autossômico dominante. Apresenta lesões usualmente presentes no nascimento ou início da infância, porém algumas vezes a condição se desenvolve na adolescência. São placas brancas simétricas, difusas, espessas, corrugadas ou verrucosas, que na maioria dos casos, afetam a mucosa bucal bilateralmente

A sífilis congênita pode alterar a formação dos incisivos, chamados de incisivos de Hutchinson, e dos molares posteriores (molares de Fournier)