Selantes ionoméricos apresentam melhor retenção e efetividade do que selantes resinosos.

Crianças com nível socioeconômico mais baixo, com pais com menor escolaridade e menos acesso a serviços de saúde bucal apresentam maior vulnerabilidade à cárie e, portanto, apresentam indicação para a aplicação de selantes de fossas e fissuras.

A efetividade de selantes independe de sua retenção. A aplicação do selante mesmo durante um curto período de tempo já é suficiente para impedir a instalação precoce de Streptococcus mutans na superfície dentária no momento considerado mais crítico.

Selantes não devem ser utilizados caso lesões cariosas iniciais já estejam presentes. Nesses casos, a lesão cariosa será ocultada e progredirá sem a possibilidade de sua proservação.

A aplicação de selantes em crianças com limitações físicas ou intelectuais não está indicada devido à dificuldade para sua realização e à baixa cooperação dessas crianças.