O uso do hidróxido de cálcio P.A. é mandatório em biopulpectomias devido à sua ação bactericida imediata, sendo preferível o uso de veículos oleosos para acelerar a dissociação iônica e o aumento do pH tecidual.

O paramonoclorofenol canforado deve ser a medicação de escolha em biopulpectomias por sua baixa tensão superficial, garantindo a biocompatibilidade necessária para a reparação do ligamento periodontal.

Em casos de biopulpectomia, a ausência de medicação intracanal (canal vazio com selamento coronário) é formalmente contraindicada, independentemente do tempo entre as sessões, devido ao risco de contaminação por via hematogênica (anacorese).

Associações de corticosteroides com antibióticos (como o Otosporin) são indicadas para o controle da dor pós-operatória imediata, atuando na inibição da fosfolipase A2 e reduzindo a síntese de mediadores químicos da inflamação no coto pulpar.