A escolha do porta-enxerto tem importância secundária em frutíferas perenes, pois suas principais funções se restringem ao sucesso inicial da enxertia, sem influência relevante sobre o comportamento produtivo da copa ao longo dos anos.

Em condições de restrição hídrica e limitações físicas do solo, a escolha do porta-enxerto deve considerar, entre outros fatores, sua capacidade de exploração radicular, sua tolerância a estresses e sua compatibilidade com a cultivar-copa.

O uso de porta-enxertos vigorosos elimina a necessidade de adequação do espaçamento e do sistema de condução, pois o vigor radicular não interfere no equilíbrio entre crescimento vegetativo e produção.

A compatibilidade entre copa e porta-enxerto é desejável, mas não constitui fator decisivo no planejamento do pomar, desde que a enxertia apresente pegamento inicial satisfatório.

Em pomares comerciais, a seleção do porta-enxerto deve priorizar exclusivamente o aumento da produtividade inicial, independentemente dos efeitos sobre a qualidade dos frutos, a sanidade e a longevidade da planta.