A integração dos transgenes em determinadas regiões do genoma e a introdução de genes que possam prevenir a dormência de sementes ou deiscência, juntamente com os genes de características agronômicas, têm sido propostas para impedir possíveis efeitos negativos na transferência de genes para plantas invasoras.

A transferência gênica horizontal se refere a mobilização e estabilização de informação genética de um organismo para outro, até de espécies remotamente relacionadas.

Uma das idéias básicas da pesquisa em bioinformática é a noção de homologia. Na ramificação da bioinformática na genômica, a homologia é utilizada para predição de uma função de determinado gene. Dessa forma, se a seqüência do gene A, a qual possui uma função conhecida, é homóloga ao gene B, cuja função não é conhecida, então o gene B pode ter função similar ao gene A. Na ramificação da bioinformática no genoma estrutural, a homologia é utilizada para determinar quais os locais das proteínas são importantes na formação da estrutura e interação com outras proteínas.

A regulação gênica envolve uma complexa rede de eventos iniciados com um sinal extra-celular que induz aumento ou redução na atividade de uma ou mais moléculas de proteínas. A bioinformática tem sido aplicada na exploração de diferentes etapas desse processo.

A predição de estrutura de proteínas é uma aplicação da bioinformática. As estruturas primária, secundária e terciária têm sido determinadas de forma efetiva a partir da seqüência de um gene que codifica proteína específica.

No contexto da genômica, a anotação é um processo de marcar genes e outras característica do genoma em determinada seqüência de DNA.

A bioinformática possibilitou a elucidação da montagem de seqüências de DNA de alta qualidade, a partir do seqüenciamento de fragmentos de RNA (shot gun), e a predição da regulação gênica com as informações de microarranjos de mRNA e(ou) espectrometria de massa.

Bioinformática ou biologia computacional envolve o uso de técnicas de matemática aplicada, informática, estatística e ciência da computação para a solução de problemas biológicos. Na bioinformática, estuda-se, entre outros, o alinhamento de seqüências, descoberta de genes, alinhamento da estrutura de proteínas e modelagem.

O fluxo gênico refere-se a troca de informações entre indivíduos, populações ou espécies com a preservação da informação genética nas populações subseqüentes. O fluxo gênico somente se estabelece quando há isolamento entre as espécies consideradas e o cruzamento entre elas não ocorre.

A biossegurança consiste de um conjunto de medidas voltadas para a prevenção, minimização ou eliminação dos riscos inerentes as atividades de pesquisa, produção, desenvolvimento tecnológico, entre outros, que possam comprometer a saúde do homem, dos animais, do meio ambiente ou a qualidade dos trabalhos desenvolvidos.